E LABORATÓRIO DE ANÁLISE DE SEQUÊNCIAS BIOLÓGICAS
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Este laboratório já teve trabalhos realizados com diversos organismos e temas da Genética de Microrganismos. Foi estudado o mecanismo de transposição do bacteriófago Mu. Posteriormente foram isolados e estudados elementos de transposição de Salmonella typhimurium. Entre estes, o Tn4527, se mostrou um transposon único, por ser constituido por partes semelhantes ao conhecido transposon Tn7, incluindo algumas de suas proteinas envolvidas na transposição, mas ao mesmo tempo sendo flanqueado por sequências de inserção em repetição direta, sequências estas praticamentes iguais ao IS1. Isto modifica o modo de transposição do transposon.
Mais recentemente o laboratório tem concentrado seus esforços em diversos aspectos da Genética Bacteriana e Microbiologia estudados usando como modelo a bactéria Vibrio cholerae. Esta espécie bacteriana tem aspectos muito interessantes, que mostram uma grande versatilidade em seu modo de vida. Ao mesmo tempo que algumas linhagens dessa espécie são patogênicas para o homem e causam epidemias de cólera, esta espécie está normalmente espalhada na natureza, estando presente em ambientes aquáticos, estuarinos e marinhos. Além disso existem associações da mesma com invertebrados marinhos tais como copépodos e ainda com plantas aquáticas. Isto permite uma integração multidisciplinar da Genética, Microbiologia, Ecologia e Epidemiologia.
Conexões imediatas
UFRJ, Instituto de Biologia, 
Departamento de Genética 
Pós-graduação em Genética Página de Ana Coelho
- ANÁLISE DA ESTRUTURA GENÔMICA DE VIBRIO CHOLERAE
DNA repetitivo. Localização e sequenciamento.
Técnicas de análise global de genoma (RAPD, ERIC-PCR).
DNA ribossômico.
- ESTUDO DE GENES DE VIRULÊNCIA
Detecção da presença e estudo do modo de atuação de genes de virulência em linhagens patogênicas e ambientais. Entre os genes estudados estão os da toxina colérica, o da toxina termo-estável, tcpA, e os genes regulatórios toxR e toxT.
- EXPRESSÃO GÊNICA DE V. CHOLERAE
Expressão gênica de V. cholerae no meio ambiente.Visa a detecção de genes induzidos especificamente na interação de V. cholerae com o ambiente, e particularmente em associações com hospedeiros tais como invertebrados marinhos.
Expressão de genes de virulência.
- ESTUDO MOLECULAR DA VARIANTE AMAZÔNIA DE V. CHOLERAE.
Este variante de V. cholerae O1 patogênico foi descrito por nosso grupo e descoberto a partir de um conjunto de linhagens provenientes de S. Paulo de Olivença (Amazonas). Elas são não toxigênicas e provocam, num sistema de alça intestinal de coelhos, uma destruição do tecido epitelial e acúmulo de muco, ao invés do efeito usual de acúmulo de líquido. Queremos investigar por técnicas de DNA alguns genes de virulência deste variante de V. cholerae, com o objetivo de estudar o modo de patogenicidade deste organismo.
- HEMOLISINA DE V. CHOLERAE
Estudamos a atividade citotóxica do sobrenadantes de linhagens Amazonia de V. cholerae, e verificamos que em baixas concentrações esta atividade causava a formação de vacúolos em células de mamíferos. Verificamos posteriormente que a atividade formadora de vacúolos é a hemolisina de V. cholerae. Queremos examinar o modo de formação destes vacúolos.
- BIODIVERSIDADE DE V. CHOLERAE
Diversidade molecular de Vibrio cholerae ambientais no Estado do Rio de Janeiro. Estamos fazendo o isolamento de V. cholerae a partir de amostras ambientais coletadas em manguezais e principalmente a partir de invertebrados marinhos, tais como moluscos e caranguejos.
Estudo de metodologias moleculares para estudos de biodiversidade (RAPD, ERIC-PCR).
- TAXONOMIA DO GÊNERO VIBRIO
Isolamento e taxonomia clássica de Vibrios ambientais.
Taxonomia molecular de Vibrios ambientais.
- DNA RIBOSSÔMICO DE VIBRIOS
Sequenciamento de rDNA e amplificação por PCR de regiões variáveis.
Análise do tamanho da região variável V1 do RNA ribossômico 16S de diferentes espécies.
Estudos com SSCP para diferenciação de genoespécies.
- Role of the G segment in the growth of phage Mu (1978) N. Symonds e Ana Coelho. Nature 271 (5645) 573-574.
- The Isolation and Characteristics of Plasmids Derived from the Insertion of MupAp1 into pML2: their behaviour during Transposition (1980) S.Maynard-Smith, D.Leach, Ana Coelho, J. Carey e N. Symonds. Plasmid 4, 34-50.
- Transposition Studies Using a Col E1 Derivative Carrying Bacteriophage Mu (1980) Ana Coelho; D. Leach; S. Maynard-Smith e N. Symonds. Cold Spring Harbor Symp.on Quant. Biol. 45, 323-328.
- Analysis of Proteins Synthesized by Plasmids Containing Cloned Fragments of Bacteriophage Mu (1981) Ana Coelho e N. Symonds. FEMS Microbiology Letters 11, 101- 106.
- Abnormal Cointegrate Structures Formed by Gene B Mutants of Phage Mu (1982) Ana Coelho; S.Maynard-Smith e N.Symonds. Molec. Gen. Genetics 185, 356-362.
- Transposons: a Dança dos Genes (1986) Ana Coelho. Ciência Hoje 4 (22), 36-41.
- The isolation of a 20kb transposon, Tn4527, carrying resistance to trimethoprim, spectinomycin and streptomycin (1989) AT Dumans e A. Coelho. Rev. Bras. Genética 12, 189- 200.
- Tn4527, a Tp Sp/Sm transposon related to Tn7 and flanked by IS1 (1989) AT Dumans, MF Carvalho e A. Coelho. Plasmid 22, 256-259.
- Vibrio cholerae in South America: PCR and zymovar analysis. (1993) Salles, CA; H Momen, ACP Vicente e Ana Coelho. Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene 87, 272.
- An analysis of the V1 and V2 regions of the Vibrio cholerae and Vibrio mimicus 16S rRNA. (1994). Coelho, A; Momen, H; Vicente, ACP e Salles, CA. Research in Microbiology 145:151-156.
- Bengal: El Tor cholera in a new robe.(1994) Salles, CA; Momen, H; Coelho, A; Oliveira, EF e Vicente, AC, Balakrish Nair, G. Memórias do Inst. Oswaldo Cruz 89 (1):115-116.
- A new variant of Vibrio cholerae O1 from clinical isolates in Amazonia. (1995) Coelho, A; J.R.C. Andrade, A. C. P. Vicente e C.A. Salles. Journal of Clinical Microbiology 33:114-118.
- The distinction of pathogenic Vibrio cholerae groups using arbitrarily primed PCR fingerprints. (1995) Coelho, A; A.C.P. Vicente; M.A.S. Baptista; H. Momen; FARW Santos and C.A. Salles. Res. Microbiology 146:671-683.
- Effect of glucose on photodynamic action of methylene blue in Escherichia coli cells. (1996) Capella, M; Coelho, AM and Menezes, S. Photochemistry & Photobiology 64:205-210.
- Genomic fingerprints of Vibrio cholerae using arbitrary primer PCR are useful epidemiological tools. (1997) Coelho, A, JRC Andrade, MAS Baptista, ACP Vicente, LR Ferraz e CA Salles. In Cytokines, Cholera and the Gut, ed. GT Keusch & M Kawakami, IOS Press, Estados Unidos, cap.28, pp.203-211.
- Molecular characterization of TCP cluster in non-O1, non-O139 Vibrio cholerae. (1997) Vicente, ACP, Novaes, RC, Coelho, A e Salles, CA. In Cytokines, Cholera and the Gut, ed. GT Keusch & M Kawakami, IOS Press, Estados Unidos, cap. 33, pp.243-248.
- Detection of Vibrio cholerae and Vibrio mimicus heat- stable toxin gene sequence by PCR. (1997) Vicente, ACP, Coelho, A & Salles, CA. J. Med. Microbiol. 47:398-402.
- The Amazonia variant of Vibrio cholerae: molecular identification and study of virulence genes. (1998) Baptista, MAS, Andrade, JRC, Vicente, ACP & Coelho, A. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz 93(5):601-607.
- Toxin-co-regulated pilus cluster in non-O1, non-toxigenic Vibrio cholerae: evidences of a third allele of the pilin gene. (1999) Novais, RC, Coelho, A, Salles, CA &Vicente, ACP. FEMS Microbiology Letters 171:49-55.
- Cytotoxic cell vacuolating activity from Vibrio cholerae hemolysin (2000) Coelho, A, JRC Andrade, ACP Vicente & VJ DiRita. Infection & Immunity 68(3):1700-1705.
- é verdade que, na atual classificação dos seres vivos, existe um novo reino que inclui as bactérias encontradas nas geleiras da Antártica? (2000) Coelho, A. Ciência Hoje 27 (162) 8.
- Qual a relação entre os elementos transponíveis e a resistência de bactérias a antibióticos? (2001) Coelho, A. Ciência Hoje 29 (170):4-5.
- "Red complex" (Bacteroides forsythus, Porphyromonas gingivalis, and Treponema denticola) in endodontic infections: A molecular approach. (2001) Roças IN, Siqueira JF Jr, Santos KR, Coelho AM. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod. 91(4):468-71.
- The Vibrio cholerae haemolysin anion channel is required for cell vacuolation and death. (2002) Moschioni M, Tombola F, Bernard M, Coelho A, Zitzer A, Zoratti M, Montecucco C. Cellular Microbiology 4(7):397-409.
- A Proteome Reference Map for Vibrio cholerae El Tor. (2004) Coelho A, Santos EO, Faria MLH, Carvalho DP, Soares MR, von Kruger WMA, Bisch PM. Proteomics, 4(5):1491-1504.
- The neuraminidase gene is present in the non-toxigenic O1 Vibrio cholerae Amazonia strain: a different allele in comparison to the pandemic strains.(2005) Figueiredo SC, Neves-Borges AC, Coelho A. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 100(6):663-669.
- 1990s Vibrio cholerae epidemic, Brazil.(2005) Vicente ACP, Coelho A. Emerging Infectious Diseases 11(1):171-173.
- Vibrio cholerae populations and their role in Latin America. (2006) Vicente ACP, Rivera IN, Vieira MD, Coelho A. In: Thompson FL; Austin B; Swings J. (Org.) The Biology of Vibrios. 1ed.Maryland: ASM, American Society for Microbiology, 1:239-247.
- N-acetylglucosamine utilization pathway in Vibrio cholerae El Tor. (2007) Santos EO, Coelho A. In: User's Meeting 2006-LNLS- Brazilian Synchroton Light Laboratory, Campinas. Activity report 2006-LNLS-Brazilian Synchroton Light Laboratory. Campinas: ABTLUS, 1:1-2.
- Protein expression profile of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5, a sugarcane endophytic plant growth-promoting bacterium. (2008) Lery, Leticia MS, Coelho Ana, Gonçalves, Mayla SM, Santos, Eidy O, Bisch, Paulo M. Proteomics 8:1631-1644.
- Molecular Evidence of HTLV-1 Horizontal Transmission and Development of Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma in 21-Year-Old Man.(2009) Espinola OM, Vicente ACP, Leite ACCB, Coelho Ana, Schor D, Otsuki MER, Lenzi MJ, Andrada-Serpa MJ. AIDS Research and Human Retroviruses, 25:1261-1262.
- Complete genome sequence of the sugarcane nitrogen-fixing endophyte Gluconacetobacter diazotrophicus PAL-5. (2009) Bertalan M, Coelho Ana, Santos Eidy O, Amaral GRS, Neves-Borges AC, Sachetto-Martins G, Ferreira PC. BMC Genomics, 10:450-456.
- Bacterial diversity associated with the Brazilian endemic reef coral Mussismilia braziliensis. (2009) Reis AMM, Araújo Jr SD, Moura RL, Francini-Filho RB, Pappas Jr GJ, Coelho A, Kruger RH, Thompson FL. Journal of Applied Microbiology, 106:1378-1387.
- Transcriptome of the southern muriqui Brachyteles arachnoides (Primates:Platyrrhini), a critically endangered New World monkey: evidence of adaptive evolution. (2020). Moreira D, Lamarca A, Soares R, Coelho Ana, Furtado C, Scherer N, Moreira MAM, Seuanez H, Boroni M. Frontiers in Genetics, Aceito para publicação.
Monografia de graduação
- Coelho, Ana. (2015) Avaliação do sistema de classificação de proteínas ricas em glicina com o uso de análise de agrupamento não supervisionado. Orientador: Raul Rentería. Rio de Janeiro: PUC-RJ.
Sequências depositadas no GENBANK
- 16S rRNA gene de Vibrio cholerae (parcial): acesso L05178, de 1992.
- Sequencia completa do gen da hemolisina (hlyA) da variante Amazonia de Vibrio cholerae: acesso AF194418, de 1999.
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Teses de mestrado orientadas por Ana Coelho:
- Ana Teresa Nogueira Dumans. Bolsa: CNPq. Março de 1984 a outubro de 1988.
- Ludmila Mueller Costa de Castro Leal. Bolsa: CAPES. Março de 1984 a agosto de 1987.
- Vivian Susane Eskenassis. Bolsa: CNPq. Março de 1984 a dezembro de 1988
- Magda Maria Ferreira Carvalho. Bolsa: CNPq. Janeiro de 1988 a janeiro de 1990
- César Borges Barros. Bolsa: CNPq. Março de 1995 a fevereiro de 2000.
- Marcelo André de Souza Baptista. Bolsa: CAPES. Agosto de 1995 a julho de 2000.
- Mauro Luiz da Hora Faria. Início: Agosto de 2001 a 2003.
- Eidy de Oliveira Santos.Término em 2005.
- Michelle Domingos Vieira. Término em 2006.
- Gilda Rose Silva do Amaral. Término em 2008.
- Janaina de Moraes Maciel Leme. Término em 2008.
- Rodrigo Carvalho Reis. Término em 2009.
- Mayla Stelman de Medeiros Gonçalves. Término em 2009.
- Antônio Alves dos Santos Neto (co-orientação). Término em 2010.
Teses de doutorado orientadas por Ana Coelho:
- Carlos Augusto Gomes Soares. Bolsa: CAPES. Maio de 1994- dezembro de 2000.
- Sonia Catarina de Abreu Figueiredo. Agosto de 2001-2006.
- Eidy de Oliveira Santos. Término em 2009.
Orientação de Pós-doutorado:
- Márcio Martins Loureiro. 2010.
Orientação de Aperfeiçoamento em Genética:
- Simone Bucker Ribeiro- 1989
- Ângelo Mourão Filho- 1992
- Hernan Soto Gonzales- 1999-2001
Orientação de estagiários de Iniciação científica:
- Ana Teresa Nogueira Dumans- Jan. 1983- Fev 1984
- Ludmila Mueller Costa de Castro Leal- Jan. 1983 -Fev 1984. Bolsa do CNPq
- Vivian Susane Eskenassis- Jan. 1983- Fev. 1984
- Artêmio de Alencar Junior- 1986
- Antônio Galina Filho- Ago. 1986- Dez 1987. Bolsa do CNPq
- Cristiana Monteiro- 1987-1988
- Simone Bucker Ribeiro- 1988. Bolsa do CNPq
- João Lima Amarante (Santa úrsula)- 1988- 1990. Bolsa do CNPq
- Cláudia Torres Ribeiro- 1989- 1990
- Carlos Henrique Lopes Alves- 1989- 1990
- Cláudia Borges- 1990
- Simone Henrique- 1991
- Angélica da Silva Barbosa- 1991
- Ângelo Mourão Filho- 1991- 92. Bolsa do CNPq
- Hadriane S.M.O. Albertos- 1992
- Marco Antônio Portilho Teixeira- 1992
- Luis Casaprima Gonzalez- 1993
- Robson Cardoso do Prado- 1991- 95. Bolsa do CNPq
- César Borges Barros- 1991 - 94. Bolsa RHAE
- Marcelo André de Souza Baptista - 1992- 95. Bolsa jovem pesquisador
- Cristina Elisa Alvarez Martinez- 1995- 96 CNPq
- Amaro E. Trindade Silva- 1997-1999 CNPq
- Eidy de Oliveira Santos- 2000-2001
- Lívia de Almeida Rodrigues- 2000
- Ingrid Siciliano Horbach- 2001
- Rodrigo Agrellos Costa- 2001
- Eidy de Oliveira Santos- 2002
- Thiago Bruce Rodrigues- 2004
- Gilda Rose Silva do Amaral- 2005
- Nelson Alves Jr- 2006
- Mayla Stelman de Medeiros Gonçalves- 2006
- Patricia Kubudi Cordeiro e Silva- 2006
- Rafael Ventura Coelho- 2007
- Paulo José Miranda da Silva Iwakami Beltrão- 2007
- Rodrigo Carvalho Reis- 2007
- Anderson Moreira da Silva-2011
Outras orientações
- Esther Helena Rondon Barretto Prado- 2002
- Anna Cristina Neves Borges- 2006
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Teses e monografias orientadas
- Isolamento e mapeamento físico do Tn4527, um transposon de S. typhimurium relacionado com o Tn7. Ana Teresa Nogueira Dumans. Mestrado em Genética(UFRJ). 1988.
- Detecção de um elemento de transposição de S. typhimurium (IS 4528) e mapeamento de uma região adjacente contendo o gene para resistencia a Km/Nm. Ludmila MCC. Leal. Mestrado em Genética(UFRJ). 1987.
- Tn4526: um transposon de S. typhimurium codificando resistencia à ampicilina. Vivian Susane Eskenassis. Mestrado em Genética(UFRJ). 1988.
- Análise da transposição do Tn4527. Magda Maria Ferreira Carvalho. Mestrado em Genética(UFRJ). 1990.
- Isolamento e análise intra-específica de Vibrio cholerae por ERIC-PCR e RAPD. Cesar Borges Barros. Mestrado em Genética(UFRJ). 2000.
- Caracterização genético-molecular dos genes regulatórios toxR e toxS e identificação de outros loci do variante Amazonia de Vibrio cholerae em comparação com o genoma de Vibrio cholerae biotipo El Tor. Marcelo André de Souza Baptista. Mestrado em Genética(UFRJ). 2000.
- Construção de uma biblioteca gênica de Vibrio cholerae El Tor e identificação de genes induzidos in vivo num sistema estuarino com o marisco Anomalocardia brasiliana. Carlos Augusto Gomes Soares. Doutorado em Genética(UFRJ). 2000.
- Regulação da hemolisina hlyA de Vibrio cholerae Amazonia: estudo dos regulons hlyU e nhaR por mapas de proteoma. Mauro Luiz da Hora Faria. Mestrado em Genética(UFRJ). 2003.
- Indução de gens do regulon nag de Vibrio cholerae El Tor por N-acetil-glicosamina. Eidy de Oliveira Santos. Mestrado em Genética(UFRJ). 2005.
- Análise Proteômica de Vibrio cholerae Amazonia e El Tor. Michelle Domingues Vieira. Mestrado em Genética(UFRJ). 2006.
- Análise do genoma de Vibrio cholerae Amazonia. Sonia Catarina de Abreu Figueiredo. Doutorado em Genética(UFRJ).2006.
- Análise proteômica comparativa de Vibrio cholerae Amazonia e de um mutante isogênico hlyU. Janaina de Moraes Maciel Leme. Mestrado em Genética(UFRJ). 2008.
- Detecção de genes de secreção do tipo IV no genoma da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus e construção de mutantes em genes traG/virD4. Gilda Rose Silva do Amaral. Mestrado em Genética(UFRJ). 2008.
- Mapeamento físico do cromossomo 2 da linhagem Amazonia de Vibrio cholerae. Rodrigo Carvalho Reis. Mestrado em Genética(UFRJ). 2009.
- Anotação do genoma de Vibrio cholerae Amazonia 3509 obtido por pirosequenciamento. Mayla Stelman de Medeiros Gonçalves. Mestrado em Genética(UFRJ). 2009.
- Proteoma de Proteobacteria: uma iniciativa da Rêde Proteômica -RJ no estudo de proteinas de Vibrio cholerae e Gluconacetobacter diazotrophicus. Eidy de Oliveira Santos. Doutorado em Genética(UFRJ) . 2009
- Análise da Expressão Gênica da Bactéria Marinha Vibrio Parahaemolyicus em N-Acetilglicosamina por Meio de Microarranjos e Biologia Computacional. Antônio Alves dos Santos Neto. Mestrado em Modelagem Computacional LNCC (co-orientação). 2010.
Monografias de fim de Graduação- Departamento de Genética da UFRJ
- Ana Teresa Nogueira Dumans.
- Ludmila MCC Leal.
- Vivian Susane Eskenassis.
- Sequenciamento do IS Direito do Tn4527 e Observação deste em Linhagens de Salmonella typhimurium. Carlos Henrique Lopes Alves. Junho 1990.
- Análise Estrutural do Tn4526: um transposon que codifica resistência a ampicilina. Cláudia Torres Ribeiro. Junho 1990.
- Obtenção de Clones da Região Reguladora da Transposição do Tn4526. Cláudia M. Borges. Novembro 1990.
- Isolamento de Vibrios e outros bacilos gram negativos de siris e caranguejos da Baía de Guanabara. Marco Antonio Portilho Teixeira. Julho 1992.
- Desenvolvimento de método de diferenciação de espécies de Vibrio através de PCR de fragmento de 16S rRNA. Robson Cardoso do Prado. Fevereiro 1995.
- Análise molecular da região variável V1 do gene 16S rRNA de linhagens ambientais de Vibrio spp. César Borges Barros. Fevereiro 1995.
- Diversidade genética entre linhagens de Vibrio cholerae não -O1 detectada pelo método de PCR com
primers arbitrários. Marcelo André de Souza Baptista. Julho 1995.
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